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  • Domaine : Masters du domaine SCIENCES, TECHNOLOGIES, SANTE
  • Diplôme : Master
  • Mention : Génétique et biologie de la cellule
  • Spécialité : Infectiologie
  • Parcours : Infectiologie
  • Unité d'enseignement : Génomique
Nombre de crédits de l'UE : 6
Code APOGEE : BIO1015M
UE Optionnelle pour ce parcours
UE valable pour le semestre 2 de ce parcours
Type d'enseignement
Nb heures *
Cours Magistraux (CM)
0 h
Travaux Dirigés (TD)
55 h
Travaux Pratiques (TP)
0 h
Total du volume horaire
55 h
* Ces horaires sont donnés à titre indicatif.
Conditions d'accès à l'UE
Au minimum, 6 crédits de Génétique moléculaire.
Programme - Contenu de l'UE
INTRODUCTION : Quels génomes sont disponibles ? Comment y accéder ? Quel est le prix et le temps nécessaire ? Chapitre1. Stratégies. Comment séquencer un génome ? Séquençage aléatoire, assemblage et finition. Chapitre2 : Annotation. Ab initio, comparaisons avec les homologues, avec le transcriptome. Signification des annotations, une annotation peut-elle être finie ? Les versions successives. Chapitre3 : Analyses à l'echelle des génomes. Orthologues et paralogues. Génomique comparative. Chapitre4 : Analyse de l'expression des génomes. Utilisations des puces à ADN. Technique alternative : le SAGE. Chapitre5. : Aide à la génétique. Génotypages Chapitre6. : Outils et stratégiesexpérimentaux dérivés. Les banques de mutants. Double hybride. Identification des protéines par spectrométrie de masse.
Compétences acquises

Méthodologiques :
Utilisation des données de la génomique. Aptitude à en comprendre la signification .
Liste des autres Parcours / Spécialité / Filière / Option utilisant cette UE
Date de la dernière mise-à-jour : 21/04/2011
(*) Les descriptifs concernant les formations de Lyon 1 sont réalisées sur ce site sous la responsabilité de chacun des pilotes d'unités d'enseignement et de diplômes. Pour une assistance à la mise à jour du site web : assistance.odf@univ-lyon1.fr